Trường được thành lập vào giai đoạn giữa năm 1946 và 1948, là một trong ba chi nhánh của Học viện nghệ thuật biểu diễn tại Praha (AMU), đồng thời là ngôi trường điện ảnh có tuổi đời lâu thứ 5 thế giới chỉ sau các trường tại Moskva, Berlin, Rome và Paris. Ngôi trường lúc đầu nằm trên tầng 4 của tòa nhà Havlickova 13, song được chuyển trụ sở sang tòa nhà Vančura tại Klimenská 4 vào năm 1948, đến năm 1960 thì một số học phần lý thuyết và lý thuyết bắt đầu được tính phí. Ngôi trường mới cũng dùng chung cơ sở vật chất với Viện điện ảnh Tiệp Khắc. Tuy nhiên, khi Viện điện ảnh Tiệp Khắc bị giải thể vào năm 1949 bởi Oldřich Macháček – giám đốc cộng sản của Hãng phim nhà nước Tiệp Khắc, rất nhiều giáo viên cũ của trường này đã chuyển sang làm trợ giảng tại FAMU.